El MEXART esta localizado en la ciénega de Coeneo, en una región predominantemente agrícola, lejos de ciudades con mucha población y actividad industrial.
El sitio esta rodeado de montañas de poca altitud y con bajos niveles de ruido electromagnético en la frecuencia de operación. Las Figuras de abajo muestran el plano de localización del observatorio. Sus coordenadas geográficas son: latitud 19° 48′ 49” norte, longitud 101° 41′ 39” oeste, y altura de 1964 m (SNM).
Las instalaciones del Observatorio están ubicadas en la colonia Félix Ireta, Bellas Fuentes, en Coeneo. Si se vive en Morelia, se puede tomar la salida a Quiroga y manejar rumbo a Zacapu; antes de llegar a Comanja se observa la desviación a la mencionada comunidad. Todas las actividades son gratuitas.